Risponde Pietro Paolo Falco: sembra banale specificarlo, ma è importante tenere presente che la tensione di una corda è direttamente proporzionale all'altezza della nota prodotta ed è in relazione con il suo spessore (oltre che alla lunghezza da punto a punto, o diapason, ma questo ora non ci interessa). Una muta di corde in accordatura standard esercita una data forza sul manico, tirandolo a sé. Il compito del truss rod è controbilanciare questa forza per tenere il manico nell'inclinazione giusta e assicurare un'action ottimale.
Se abbassi l'accordatura di un tono, le corde saranno meno tese e quindi eserciteranno una forza minore sul manico. In questo modo l'equilibrio precedentemente trovato con il setup andrà a sballarsi e il manico si arcuerà all'indietro, data la trazione del truss rod ora maggiore. Ciò abbassa l'action e fa sbattere le corde sui tasti, provocando lo sferragliamento.
Regolare il truss rod è la soluzione, ma può aiutarti anche usare una muta di corde più spesse le quali, data la maggior tensione necessaria a parità di accordatura, tireranno maggiormente dalla loro parte bilanciando nuovamente (più o meno) l'equilibrio tra corde e truss rod. Questa soluzione è consigliabile se senti le corde troppo "molli" sotto le dita per i tuoi gusti.
In ogni caso, per qualunque cambio di accordatura o spessore di corde (a volte anche solo per modello/marca di corde) è preferibile rivedere l'intonazione regolando le sellette del ponte con il cosiddetto metodo delle ottave.
Qui puoi trovare una breve guida video sulla regolazione del truss rod.
Qui invece trovi un tutorial sull'intonazione del ponte (tipo Floyd Rose, ma il principio è comune a tutti i ponti).