L'universo Fender non è solo Stratocaster e Telecaster. Una serie di modelli meno noti si sono succeduti nei primi anni, talvolta con scarso successo salvo poi tornare di gran carriera a conquistare le fantasie dei moderni appassionati di vintage.
Le vere chitarre Fender alternative alle Telecaster e Stratocaster dell'era pre-CBS furono essenzialmente tre modelli, tutti nati con la tastiera in palissandro (rosewood). In foto da sinistra, la Jaguar del 1962 con scalatura 24 pollici, la Jazzmaster del 1958 con scalatura 25,5 pollici e ultima la Mustang con scalatura 24 pollici, della fine del 1964.
Le prime due erano considerate modelli al top della produzione e solo la terza for student. Sebbene le prime Fender (Telecaster e Stratocaster) fossero nate con tastiera in acero, questi modelli "alternativi" sono da sempre impressi nella memoria dei musicisti di quegli anni con la tastiera in palissandro e molti storcono il naso vedendo, per esempio, una Jazzmaster con la tastiera in acero.

Proprio la Jazzmaster fu la prima Fender con tastiera in palissandro. Con i suoi pickup a saponetta, la chitarra nacque con lo scopo di avvicinare i chitarristi jazz alle solid body. Il modello non prese mai piede tra i jazzisti, ma fu usata da alcuni nomi noti, tra cui Joe Pass.
Jazzmaster, Mustang e Jaguar non ebbero un gran successo commerciale e furono tolte dalla produzione a fine anni '70 per ricomparire solo in epoca "rinascimento Fender", cioè dopo il periodo CBS che finì nel 1985. In particolare ebbero successo le made in Japan di quegli anni, con l'unica variante del costo identico per i tre modelli, mentre in origine la Mustang era la "Cenerentola" dal prezzo di quasi un terzo rispetto alla Jaguar, la più costosa del trio.
A queste si affiancavano le più economiche Musicmaster e Duo Sonic I, realizzate rispettivamente negli anni 1956 e 1957. Entrambi i modelli avevano una scala corta da 22,5 pollici e tastiera in acero (maple) che conservarono per tutto il decennio relativo agli anni '50.
La Musicmaster e la Duo Sonic I furono prodotte per sopperire alla poca disponibiltà economica degli studenti che poterono così permettersi di suonare un'autentica chitarra Fender.